(一)秘书科。负责区政府、区政府办文电收发、分送、转办、编号、校对、立卷、归档、印鉴管理和机关保密等工作;负责起草区政府、区政府办交办的有关公文;根据区政府、区政府办领导的批示草拟批复文稿;负责区政府大型会议、重大活动的组织以及区政府领导会议、公务活动的安排工作;指导区政府部门、镇政府(街道办事处)等的公文处理工作。
(二)区政府督查室。负责区政府党组会议、区政府常务会议、区长办公会议、区政府工作会议的有关会务、纪要拟发工作及其决定事项、重大问题执行落实的协调、检查、督办工作;负责区政府领导和上级部门批办事项的立项、督办、催办、报告及反馈工作,协助领导组织督办活动;组织办理人大代表议案、建议和政协提案,协调、检查、督促议案、建议和提案的办理工作;承办区人大常委会、区政协常委会例会应由区政府办理的有关工作。
(三)综合一科。负责分管审计、发展和改革、物价、粮食、能源、金融、科技工业商务和信息化、口岸、贸易促进、经济协作、邮政、财政、国有资产、万博商务区建设、供销合作、招商、企业建设服务、构建“链长制”推进产业高质量发展等领域区政府领导的有关会议、调研、出席活动及相关综合性文稿的组织协调工作,以及有关决定事项、重大事项的协调、检查等工作;负责审核修改以区政府、区政府办名义制发的由上述领域代拟的各类文稿;负责起草区政府工作报告、全区阶段性的经济和社会发展情况的分析和综合。
(四)综合二科。负责分管海防、三防、规划、自然资源、土地征收与开发、安全生产、应急管理、统计、城市更新、番禺经济技术开发区(广州国际商品展贸城)、消防及救援、民政、妇女儿童、残疾人、人力资源和社会保障、交通运输、乡村振兴、农业和农村、对口帮扶、对口支援、退役军人事务、信访、广州南站地区等领域区政府领导的有关会议、调研、出席活动及相关综合性文稿的组织协调工作,以及有关决定事项、重大事项的协调、检查等工作;负责审核修改以区政府、区政府办名义制发的由上述领域代拟的各类文稿。
(五)调研一科。负责分管生态环境、住房和城乡建设、美丽乡村、中心镇及名镇建设、消防建设审批、水务、城市管理、林业和园林、综合执法、基本建设、武装、供电、公安、打私、司法等领域区政府领导的有关会议、调研、出席活动及相关综合性文稿的组织协调工作,以及有关决定事项、重大事项的协调、检查等工作;负责审核修改以区政府、区政府办名义制发的由上述领域代拟的各类文稿。
(六)调研二科(区产业发展研究室)。负责分管教育、旅游、文化、体育、卫生健康、市场监管、食品药品监管、知识产权、通信、政务服务数据等方面区政府领导的有关会议、调研、出席活动及相关综合性文稿的组织协调工作,以及有关决定事项、重大事项的协调、检查等工作;负责审核修改以区政府、政府办名义制发的由上述领域代拟的各类文稿。负责对涉及全局性的经济、社会发展的重大问题开展专项调研,形成相应建议、规范性文件或工作方案;组织开展社会经济发展软课题研究;围绕区委、区政府中心工作,组织开展产业调研,对区内产业发展情况进行摸查分析,提出工作建议,为区委、区政府提供决策参考,助推我区重点产业高质量发展;负责政务信息的收集、反馈和上报工作,指导区政府系统政务信息工作;协调区政府工作部门和新闻单位对区政府重大措施出台、重要政务活动的宣传工作;负责区政府信息公开事宜,组织编制区政府信息公开指南、政府信息公开目录和政府信息公开年度报告,负责区政务公开工作领导小组的日常工作,指导、协调全区政务公开工作。
(七)人事行政科(区公务用车管理办公室)。负责协助区政府办领导处理本单位日常工作和机关事务管理工作;负责区政府办会议、活动的组织工作;负责区政府办及下属单位的党务、纪检监察、思想教育、维稳、宣传、机构编制、组织人事、劳资、培训、工青妇、老干、计生、外事、财务、资产管理、文体及后勤等工作的组织实施和管理工作。负责全区党政机关、事业单位公务用车配备、过户、报废更新的审核等工作;负责对区属定编单位公务用车进行编后的监督管理工作;会同区党廉办等有关部门查处区属定编单位的违纪、违规用车问题。
(八)城市运行协调科(区协助处理日本遗弃在华化学武器问题办公室、区委、区政府总值班室、民生热线、海防科)。负责区委、区政府总值班室工作,落实24小时值班值守;负责全区城市管理组织领导、统筹协调、监督指挥和综合考评等职责;负责城市管理重大问题的调查研究和协调工作;负责建立面向社会公众的统一受理平台,承担区委、区政府决定纳入区统一受理、监督指挥平台的各类网络、专线等平台的职责;负责城市管理与运行方面问题的受理、分解、处置责任单位的确定、任务派送以及处置情况的监督、评价、反馈;承担区城市运行指挥领导小组办公室职能;负责我区日本遗弃在华化学武器清理日常工作;调研、收集和分析海防情报资料;负责检查、督促、指导本区海防的具体工作,协调相关职能部门和沿海地区解决有关海防管控工作中出现的突出问题。
(九)外事科。指导全区重要外事活动的开展;组织接待来访的重要外宾;配合处理本区涉领事保护工作、涉外国驻穗领事机构事务及重大涉外突发事件;负责本区与国际友好合作交流关系城市(区)的缔结和交往工作;协调来本区采访的外国记者的有关工作;负责全区因公临时出国的审核和报批工作,负责全区因公出国团组、人员的护照、签证的办理工作,负责全区因公护照的领用、收缴和管理工作;负责全区因公赴港澳团组、人员的通行证、签注的办理工作,受区委统战部委托负责全区因公往来港澳通行证的领用、收缴和管理工作;负责本区APEC商务旅行卡的初审报批工作。